Na oddział na drugim piętrze trafiają pacjenci, którzy zachorowali na jedną z magicznych chorób zakaźnych. Za przykład takich chorób można podać chociażby smoczą ospę, znikanie epidemiczne oraz skrofungulusa. Oddział Zakażeń Magicznych jest najlepiej strzeżonym oddziałem w całym św. Mungu z racji tego, że magiczne choroby zakaźne bardzo szybko rozprzestrzeniają się i przechodzą na innych czarodziejów.